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| Registros recuperados : 165 | |
| 61. |  | SILVEIRA, C. A. P.; FERREIRA, L. H. G.; SILVA, S. D. dos A. e; ÁVILA, D. T. de. Avaliação do efeito imediato da adubação fosfatada e da variabilidade de plantas sobre a produção de frutos de tungue: Aleurites fordii In: SIMPÓSIO ESTADUAL DE AGROENERGIA, 3.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE AGROENERGIA, 3.; REUNIÃO TÉCNICA DA MANDIOCA, 10.; REUNIÃO TÉCNICA DA BATATA-DOCE, 2., Pelotas, 2010. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. Organizado por Sérgio Delmar dos Anjos e Silva, Ivan Rodrigues de Almeida e Ana Cláudia Barneche de Oliveira. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 63. | | LOURENÇO, Y. dos S.; NACHTIGAL, G. de F.; SILVEIRA, C. A. P.; MARTINAZZO, R.; BAMBERG, A. L. Avaliação do crescimento micelial e esporulação de isolados de Trichoderma spp. Em presença de diferentes fontes inorgânicas e orgânicas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ROCHAGEM, 3., 2017, Pelotas. Anais... Assis: Triunfal Gráfica e Editora, 2017. 455 p. Editado por Adilson Luis Banberg, Carlos Augusto Posser Silveira, Éder de Souza Martins, Magda Bergmann, Rosane Martinazzo e Suzi Huff Theodoro. p. 205-210| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 65. | | GRECCO, M. F.; BAMBERG, A. L.; LAZARI, R. de; RIBEIRO, A. L.; SILVEIRA, C. A. P.; MARTINAZZO, R. Avaliação de Diferentes Adubações a Base de Agrominerais Sobre a Produção de Matéria Seca e na Concentração de Nutrientes K, Ca e Mg na Parte Aérea de Plantas de Milho (Zea mays). In: REUNIÃO SUL-BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO, 10., 2014, Pelotas. Fatos e mitos em ciência do solo. Pelotas: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo; UFPEL, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 66. | | DOUMER, M. E.; GIACOMINI, S. J.; SILVEIRA, C. A. P.; WEILER, D. A.; BASTOS, L. M.; FREITAS, L. L. de. Atividade microbiana e enzimática em solo após a aplicação de xisto retortado. Pesquisa agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 11, p. 1538-1546, nov. 2011 Título em inglês: Microbial and enzymatic activities in the soil after application of retorted oil shale.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 68. | | PEREIRA, I. S.; SILVEIRA, C. A. P.; MESSIAS, R. S.; ANTUNES, L. E. C.; PILLON, C. N. Avaliação químico-nutricional de frutos de morangueiro (cv. Camarosa), cultivados fora de solo em diferentes substratos. In: CONGRESO NACIONAL DE LA SOCIEDAD URUGUAYA DE HORTIFRUTICULTURA, 11.; CONGRESO PANAMERICANO PROMOCIÓN DEL CONSUMO DE FRUTAS Y HORTALIZAS, 3., 2007, Montevideo. Resumos... Montevideo : Sociedad Uruguaya de Hortifruticultura, 2007. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 70. | | SILVA, M. L. e.; PEREIRA, I. dos S.; PICOLOTTO, L.; HÖHN, D.; ANTUNES, L. E. C.; SILVEIRA, C. A. P. Adubação nitrogenada na amoreira-preta: dose de máxima eficiência ecônomica. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 23.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 16., 2014, Pelotas. [Anais.]. Pelotas: UFPel, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 71. | | PEREIRA, I. S.; ANTUNES, L. E. C.; SILVEIRA, C. A. P.; GARDIN, J. P. P.; PILLON, C. N. Correlação entre densidade de hastes e produtividade da amoreira-preta. In: SIMPÓSIO NACIONAL DO MORANGO, 4.; ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 3., 2008, Pelotas. Palestras & resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2008. p. 121-122| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 72. | | RODRIGUES, M.; VAHL, L. C.; SILVEIRA, C. A. P.; SALÉ, M. M.; NANNI, M. R.; BATISTA, M. A. Co-products from the limestone mining as sources of calcium, magnesium and sulphur. Environmental Nanotechnology, Monitoring & Management, v. 15, 100446, May 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 73. | | BAMBERG, A. L.; SILVEIRA, C. A. P.; MARTINAZZO, R.; BERGMANN, M.; GRECCO, M. F.; POTES, M. DA L. Desempenho agronômico de fontes minerais e orgânicas de nutrientes para as culturas de milho e trigo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ROCHAGEM, 2., 2013, Poços de Caldas. Resumos... Poços de Caldas: Petrobras:Embrapa, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 75. | | MESSIAS, R. da S.; FERREIRA, L. H. G.; PEREIRA, B. F.; SILVEIRA, C. A. P.; PILLON, C. N. Caracterização físico-química da água de xisto visando seu uso como insumo para a agricultura. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ROCHAGEM, 1., 2010, Brasilia. Anais... Brasília, Petrobras/Embrapa, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 76. | | GRECCO, M. F.; BAMBERG, A. L.; BERGMANN, M.; SILVEIRA, C. A. P.; MARTINAZZO, R.; PINTO, L. F. S.; MATHIAS, V. Caracterização e disponibilidade de nutrientes das frações minerais mesocrática e leucocrática de granitóides da região de monte bonito, Pelotas, RS. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ROCHAGEM, 3., 2017, Pelotas. Anais... Assis: Triunfal Gráfica e Editora, 2017. 455 p. Editado por Adilson Luis Banberg, Carlos Augusto Posser Silveira, Éder de Souza Martins, Magda Bergmann, Rosane Martinazzo e Suzi Huff Theodoro. p. 179-185| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 78. | | ARAUJO, V. F.; KRAUSE, R. V.; BECKER, S.; VIGNOLO, G. K.; PIANA, C. F. de B.; SILVEIRA, C. A. P. Efeito da utilização de remineralizadores na produção de morangueiro e a dinâmica de nutrientes em área de elevada fertilidade construída. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ROCHAGEM, 3., 2017, Pelotas. Anais... Assis: Triunfal Gráfica e Editora, 2017. 455 p. Editado por Adilson Luis Banberg, Carlos Augusto Posser Silveira, Éder de Souza Martins, Magda Bergmann, Rosane Martinazzo e Suzi Huff Theodoro. p. 299-303| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 79. | | BALDEZ, D. L.; AVILA, L. O.; TORRES, D. P.; MARTINAZZO, R.; SILVEIRA, C. A. P.; VIEIRA, M. A. Determinação de potássio em rochas silicáticas por espectrometria de emissão atômica com chama após dissolução assistida por ultrassom. Quimica Nova, v. 42, n. 10, p. 1095-1100, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| Registros recuperados : 165 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
10/02/2023 |
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Data da última atualização: |
14/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; EGITO, A. A. do; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. |
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Afiliação: |
ELISA PERIPOLLI, Universidade Estadual Paulista; NEDENIA BONVINO STAFUZZA, Centro de Pesquisa em Bovinos de Corte; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; ANDREA ALVES DO EGITO, CNPGC; FERNANDO BALDI, Universidade Estadual Paulista; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL. |
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Título: |
Assessment of copy number variants in three Brazilian locally adapted cattle breeds using whole-genome re-sequencing data. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal Genetics, v. 54, n. 3, p. 254-270, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1111/age.13298 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Further characterization of genetic structural variations should strongly focus on small and endangered local breeds given their role in unraveling genes and structural variants underlying selective pressures and phenotype variation. A comprehensive genome-wide assessment of copy number variations (CNVs) based on whole-genome re-sequencing data was performed on three Brazilian locally adapted cattle breeds (Caracu Caldeano, Crioulo Lageano, and Pantaneiro) using the ARS-UCD1.2 genome assembly. Data from 36 individuals with an average coverage depth of 14.07× per individual was used. A total of 24?945 CNVs were identified distributed among the breeds (Caracu Caldeano = 7285, Crioulo Lageano = 7297, and Pantaneiro = 10 363). Deletion events were 1.75?2.07-fold higher than duplications, and the total length of CNVs is composed mostly of a high number of segments between 10 and 30?kb. CNV regions (CNVRs) are not uniformly scattered throughout the genomes (n = 463), and 105 CNVRs were found overlapping among the studied breeds. Functional annotation of the CNVRs revealed variants with high consequence on protein sequence harboring relevant genes, in which we highlighted the BOLA-DQB, BOLA-DQA5, CD1A, ?-defensins, PRG3, and ULBP21 genes. Enrichment analysis based on the gene list retrieved from the CNVRs disclosed over-represented terms (p?MenosFurther characterization of genetic structural variations should strongly focus on small and endangered local breeds given their role in unraveling genes and structural variants underlying selective pressures and phenotype variation. A comprehensive genome-wide assessment of copy number variations (CNVs) based on whole-genome re-sequencing data was performed on three Brazilian locally adapted cattle breeds (Caracu Caldeano, Crioulo Lageano, and Pantaneiro) using the ARS-UCD1.2 genome assembly. Data from 36 individuals with an average coverage depth of 14.07× per individual was used. A total of 24?945 CNVs were identified distributed among the breeds (Caracu Caldeano = 7285, Crioulo Lageano = 7297, and Pantaneiro = 10 363). Deletion events were 1.75?2.07-fold higher than duplications, and the total length of CNVs is composed mostly of a high number of segments between 10 and 30?kb. CNV regions (CNVRs) are not uniformly scattered throughout the genomes (n = 463), and 105 CNVRs were found overlapping among the studied breeds. Functional annotation of the CNVRs revealed variants with high consequence on protein sequence harboring relevant genes, in which we highlighted the BOLA-DQB, BOLA-DQA5, CD1A, ?-defensins, PRG3, and ULBP21 genes. Enrichment analysis based on the gene list retrieved from the CNVRs disclosed over-represented terms (p?Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Variação fenotípica. |
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Thesagro: |
Bovino; Gado Crioulo; Genoma; Raça. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151656/1/Assessment-of-copy-number-variants-in-three-Brazilian.pdf
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Marc: |
LEADER 02604naa a2200265 a 4500
001 2151656
005 2023-06-14
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1111/age.13298$2DOI
100 1 $aPERIPOLLI, E.
245 $aAssessment of copy number variants in three Brazilian locally adapted cattle breeds using whole-genome re-sequencing data.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aFurther characterization of genetic structural variations should strongly focus on small and endangered local breeds given their role in unraveling genes and structural variants underlying selective pressures and phenotype variation. A comprehensive genome-wide assessment of copy number variations (CNVs) based on whole-genome re-sequencing data was performed on three Brazilian locally adapted cattle breeds (Caracu Caldeano, Crioulo Lageano, and Pantaneiro) using the ARS-UCD1.2 genome assembly. Data from 36 individuals with an average coverage depth of 14.07× per individual was used. A total of 24?945 CNVs were identified distributed among the breeds (Caracu Caldeano = 7285, Crioulo Lageano = 7297, and Pantaneiro = 10 363). Deletion events were 1.75?2.07-fold higher than duplications, and the total length of CNVs is composed mostly of a high number of segments between 10 and 30?kb. CNV regions (CNVRs) are not uniformly scattered throughout the genomes (n = 463), and 105 CNVRs were found overlapping among the studied breeds. Functional annotation of the CNVRs revealed variants with high consequence on protein sequence harboring relevant genes, in which we highlighted the BOLA-DQB, BOLA-DQA5, CD1A, ?-defensins, PRG3, and ULBP21 genes. Enrichment analysis based on the gene list retrieved from the CNVRs disclosed over-represented terms (p?<?0.01) strongly associated with immunity and cattle resilience to harsh environments. Additionally, QTL associated with body conformation and dairy-related traits were also unveiled within the CNVRs. These results provide better understanding of the selective forces shaping the genome of such cattle breeds and identify traces of natural selection pressures by which these populations have been exposed to challenging environmental conditions.
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700 1 $aBALDI, F.
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773 $tAnimal Genetics$gv. 54, n. 3, p. 254-270, 2023.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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